1 сентября 1967 года открыла свои двери новая восьмилетняя школа № 6 города Дубны по улице Мира, дом 1 на основании решения № 120 исполкома Дубненского городского Совета депутатов трудящихся Московской области от 11.05.1967 года, протокол № 14.
С первых лет деятельности, несмотря на статус «восьмилетки» школа № 6 завоевала звание учебного учреждения, в котором заботятся не только о знаниях учащихся, но и об их здоровье, интеллектуальном и творческом развитии. Первые спортивные классы, первые победители олимпиад, первый в городе Клуб интернациональной дружбы, первые театрализованные конференции на английском языке – все это восьмилетняя школа № 6. 
В результате реорганизации восьмилетней школы № 6 была создана средняя школа № 6 города Дубны (решение исполкома Дубненского городского Совета народных депутатов от 25.01.1985 года № 27/2). Школа № 6 переехала в новое здание и получила новую прописку: улица Б.М. Понтекорво, дом 16. 
На базе средней школы № 6 города Дубны была открыта общеобразовательная школа-лицей № 6 города Дубны Московской области (решение исполкома Дубненского городского Совета народных депутатов от 12.12.1991 года № 604/25). Постановлением Губернатора Московской области от 09.08.2006 года № 109-ПГ лицею присвоено имя Героя Социалистического Труда, академика Г.Н. Флёрова.
Наименование лицея в соответствии с редакцией его устава, утвержденного постановлением главы Администрации г. Дубны Московской области от 29.07.2011 года № 456-ПГ: муниципальное бюджетное общеобразовательное учреждение города Дубны Московской области, лицей № 6 имени академика Г.Н. Флёрова.
Лицей № 6 принял победную эстафету от своих предшественников (восьмилетней и средней школы № 6), приумножил и не посрамил их заслуги.
Директор лицея №6 Кренделева Наталья Георгиевна
Обращение директора лицея Натальи Георгиевны Кренделевой
Здравствуйте! Уважаемые родители, друзья нашего Лицея, все, кто доверяет нам своих детей, кто хочет познакомиться с нашим Лицеем! Мы рады приветствовать Вас на сайте Лицея № 6 имени академика Г.Н. Флёрова
На страницах сайта Вы можете узнать об истории создания Лицея, получить информацию о его деятельности, о жизни наших лицеистов и педагогов, о работе структурных подразделений и основных направлениях работы Лицея. На нашем сайте Вы найдёте полезную, интересующую Вас информацию, сможете задать вопросы руководству Лицея и получить на них ответы.
Лицей реализует Программу развития — Проект 5С: Содружество-Сотрудничество-Сопереживание-Сотворчество-Соуправление.
Кредо нашей Программы:
Сотворчеством прекрасен наш лицей!
В содружестве вершины покоряем
В соуправлении мы достигаем цель,
В сотрудничестве сопереживаем.
Желаю Вам приятного знакомства с нашим Лицеем.
