В Муниципальном бюджетном общеобразовательном учреждении города Дубны Московской области, лицее № 6 имени академика Г.Н. Флёрова постоянно действуют и работают:
Кафедра начального общего образования
Кафедра естественно-математических дисциплин
Кафедра гуманитарных дисциплин
Кафедра воспитания, психологии и социализации
Образцовый Театр-студия «Экополис»
Школьный парламент
Научное лицейское общество (НЛО)
Школьный музей “История школы № 6″
Общественное объединение лицеистов ЮИД
Литературно-исторический клуб «Эрудит»
Спортивный клуб «Позитрон»
Медиацентр «Атом»
Шахматный клуб «Дебют»
Общероссийская общественно-государственная детско-юношеская организация «Российское движение школьников»
С 1 сентября 2019 года на базе Лицея № 6 будет реализовываться проект Яндекс Лицей. Региональным партнером данного проекта выступает ОИЯИ.